Como se recordará, la cámara baja salteña acordó en su reunión del pasado 14 de mayo enviar al Consejo de la Magistratura los antecedentes del llamado caso Thomas.Este suceso saltó a la consideración de la opinión pública el día 4 de mayo de 2008, cuando el diputado justicialista por Metán Horacio Thomas fue sometido a un procedimiento de registro de su vehículo por personal de Gendarmería Nacional, el que fue objetado por la Cámara de Diputados por lesionar los privilegios parlamentarios.
Ante este suceso, la cámara requirió explicaciones a las autoridades locales de Gendarmería y el presidente Godoy llegó a mantener una reunión con el juez Cornejo.
Toda vez que Cornejo respaldó lo actuado por la Gendarmería y consideró que la actuación de la fuerza en el caso Thomas fue respetuosa de los privilegios parlamentarios, los diputados salteños resolvieron denunciarlo para que el Consejo de la Magistratura determine si Cornejo ha incurrido o no en responsabilidad por este hecho.
El expediente contra el juez salteño tramita bajo el número 196/08 y es, según fuentes judiciales citadas por Nuevo Diario, el tercero incoado contra Cornejo en el Consejo de la Magistratura Nacional.